Baru pada menit ke-70, Manchester City memecah kebuntuan via Aguero.
Memanfaatkan servis dari David Silva, striker asal Argentina itu melepaskan tendangan kaki kanan ke pojok kiri gawang Brighton.
Lima menit berselang, Manchester City menggandakan keunggulan berkat kesalahan Lewis Dunk dalam mengantisipasi bola.
Pasukan Josep Guardiola terus menekan, tetapi gagal mencetak gol ketiga.
Tak pelak, skor 2-0 untuk kemenangan Manchester City terpampang saat peluit panjang dibunyikan wasit.
Dengan hasil ini, The Citizens bertengger di posisi kedua klasemen sementara dengan koleksi tiga poin atau cuma terpaut selisih gol dari Huddersfield Town di puncak.
Brighton and Hove Albion 0-2 Manchester City (Sergio Aguero 70'; Lewis Dunk 75'-bd)
Brighton and Hove Albion: 1-Mat Ryan; 2-Bruno, 22-Shane Duffy, 5-Lewis Dunk, 29-Markus Suttner; 20-Solly March, 6-Dale Stephens, 24-Dav Propper, 37-Isaiah Brownl 13-Pascal Grob, 10-Tomer Hemed
Pelatih: Chris Hughton
Manchester City: 31-Ederson; 4-Vincent Kompany, 5-John Stones, 30-Nicolas Otamendi; 2-Kyle Walker, 17-Kevin De Bruyne, 21-David Silva, 25-Fernandinho, 3-Danilo; 10-Sergio Aguero, 33-Gabriel Jesus
Pelatih: Josep Guardiola