Peluang terbaik Bayern datang pada menit ke-30 via Mats Hummels yang menyambut umpan James Rodriguez dengan sundulan.
Namun, Fabri mampu menepis bola dan menyelamatkan gawangnya.
Gol yang ditunggu-tunggu Bayern datang pada menit ke-42 melalui Thomas Mueller.
Berawal dari tusukan Kingsley Coman dari sisi kanan pertahanan Besiktas, bola mengenai kaki David Alaba dan memantul sebelum mendarat ke kaki Mueller.
Tanpa kesulitan, Mueller melepas tembakan jarak dekat dan bola meluncur di antara kedua kaki Fabri menembus gawang Besiktas.
FC Bayern Muenchen 1-0 Besiktas (Thomas Mueller, 43')
SUSUNAN PEMAIN
FC Bayern Muenchen: 26-Sven Ulreich; 32-Joshua Kimmich, 17-Jerome Boateng, 5-Mats Hummels, 27-David Alaba; 8-Javi Martínez, 23-Arturo Vidal; 11-James Rodriguez (10-Arjen Robben, 44'); 29-Kingsley Coman, 9-RObert Lewandowski, 25-Thomas Mueller
Pelatih: Jupp Heynckes
Besiktas: 1-Fabri; 3-Adriano, 5-Pepe, 21-Domagoj Vida, 88-Caner Erkin; 12-Gary Medel, 13-Atiba Hutchinson; 7-Ricardo Quaresma, 94-Talisca, 8-Ryan Babel; 30-Vagner Love
Pelatih: Senol Gunes
Wasit: Ovidiu Hatigan