Pada percobaan terakhirnya pun, Marquez hampir terjatuh di tikungan 3 yang membuat catatan waktunya di sektor pertama lebih lambat.
Namun, Marquez mampu melakukan penyelamatan dan meningkatkan kecepatan motornya di sektor-sektor selanjutnya untuk menutup babak kualifikasi dengan catatan waktu putaran 1 menit 20,270 detik.
Posisi start kedua akhirnya menjadi milik Petrucci, sedangkan posisi start ketiga jatuh ke tangan Jorge Lorenzo (Ducati).
Sementara itu, baris kedua balapan MotoGP Jerman 2018 akan ditempati oleh Maverick Vinales (Movistar Yamaha), Andrea Dovizioso (Ducati), dan Valentino Rossi (Movistar Yamaha).
Berikut hasil lengkap kualifikasi MotoGP Jerman 2018.
| Pos. | Rider | Team | Time |
|---|---|---|---|
| 1 | Marc MARQUEZ | Repsol Honda Team | 1'20.270 |
| 2 | Danilo PETRUCCI | Alma Pramac Racing | 1'20.295 |
| 3 | Jorge LORENZO | Ducati Team | 1'20.327 |
| 4 | Maverick VIÑALES | Movistar Yamaha MotoGP | 1'20.441 |
| 5 | Andrea DOVIZIOSO | Ducati Team | 1'20.444 |
| 6 | Valentino ROSSI | Movistar Yamaha MotoGP | 1'20.532 |
| 7 | Cal CRUTCHLOW | LCR Honda CASTROL | 1'20.675 |
| 8 | Andrea IANNONE | Team SUZUKI ECSTAR | 1'20.682 |
| 9 | Alvaro BAUTISTA | Angel Nieto Team | 1'20.700 |
| 10 | Dani PEDROSA | Repsol Honda Team | 1'20.831 |
| 11 | Alex RINS | Team SUZUKI ECSTAR | 1'20.847 |
| 12 | Takaaki NAKAGAMI | LCR Honda IDEMITSU | 1'20.938 |
| 13 | Aleix ESPARGARO | Aprilia Racing Team Gresini | 1'20.972 |
| 14 | Johann ZARCO | Monster Yamaha Tech 3 | 1'21.059 |
| 15 | Jack MILLER | Alma Pramac Racing | 1'21.183 |
| 16 | Pol ESPARGARO | Red Bull KTM Factory Racing | 1'21.242 |
| 17 | Bradley SMITH | Red Bull KTM Factory Racing | 1'21.287 |
| 18 | Hafizh SYAHRIN | Monster Yamaha Tech 3 | 1'21.460 |
| 19 | Tito RABAT | Reale Avintia Racing | 1'21.546 |
| 20 | Scott REDDING | Aprilia Racing Team Gresini | 1'21.749 |
| 21 | Stefan BRADL | EG 0,0 Marc VDS | 1'21.802 |
| 22 | Thomas LUTHI | EG 0,0 Marc VDS | 1'22.012 |
| 23 | Karel ABRAHAM | Angel Nieto Team | 1'22.159 |
| 24 | Xavier SIMEON | Reale Avintia Racing | 1'22.709 |