Bernardo Silva berusaha menghadirkan gol ketiga buat City pada menit ke-40 via tembakan jarak jauh, tetapi ditepis penjaga gawang lawan.
Baca Juga: Tikung Barcelona, Real Madrid Bakal Rebut Pemain Idaman Messi
Selepas turun minum, baik City maupun Southampton bisa mencetak masing-masing satu gol.
Aguero kembali mencatatkan namannya di papan skor pada menit ke-56 untuk mengubah kedudukan jadi 3-0.
Southampton lantas merespons.
Lewat situasi sepak pojok yang terjadi pada menit ke-75, tim tamu mendapatkan gol balasan dari tandukan Jack Stephens.
Baca Juga: Lionel Messi Memasuki Masa 'Suram' di La Liga Gara-gara Cedera
Tak ada gol tambahan lagi hingga terdengar bunyi panjang peluit.
Kemenangan ini membawa City melenggang ke perempat final Piala Liga Inggris 2019-2020.
Manchester City 3-1 Southampton (Nicolas Otamendi 20', Sergio Aguero 38', 56'; Jack Stephens 75')