Dan saat itu peringkat tiga diisi oleh Persipura Jayapura.
PSSI sendiri memilih Persija Jakarta karena keluar sebagai runner-up Piala Indonesia.
Karena di regulasi tidak tertera diperbolehkannya runner-up kompetisi domestik akhirnya AFC meminta PSSI mengganti wakilnya.
Atas dasar itu akhirnya PSSI menunjuk Persipura Jayapura sebagai teman dari Bali United untuk wakil Indonesia di Piala AFC 2021.
Baca Juga: PSSI Dapat Masukan dari AFC Terkait Persipura di Piala AFC 2021
"Saya sampaikan terima kasih atas dukungan publik sepak bola Indonesia atas perjuangan ini. Dukungan luar biasa kami dapatkan dari berbagai pihak, termasuk dukungan dan doa masyarakat Papua," kata Benhur Tomi Mano.
"Itu semua membuat kami kukuh untuk berjuang untuk hak kami sesuai aturan. Terima kasih banyak semuanya, salam damai selalu," tambahnya.
Nantinya Persipura Jayapura harus melangsungkan pertandingan play off terlebih dahulu sebelum lolos ke fase grup Piala AFC 2021.
Berbeda dengan Bali United yang langsung lolos ke fase grup Piala AFC 2021.